Viện thực hiện kiểm nghiệm, giám sát và đánh giá nguy cơ an toàn thực phẩm đối với nguyên liệu, phụ gia, sản phẩm thực phẩm và dụng cụ tiếp xúc với thực phẩm. Các hoạt động lấy mẫu, kiểm tra, xác định nguyên nhân ngộ độc thực phẩm được thực hiện theo đúng quy định pháp luật. Viện thẩm định, đánh giá và tư vấn quy trình, thiết bị đảm bảo an toàn trong sản xuất và chế biến thực phẩm.
Đồng thời hỗ trợ doanh nghiệp xây dựng các biện pháp phòng ngừa rủi ro về an toàn thực phẩm. Qua đó góp phần bảo vệ sức khỏe cộng đồng và nâng cao chất lượng thực phẩm trên thị trường.